Subventiile acordate companiei Olympic Airways incepand din 1992 au facut subiectul unor numeroase sesizari ale Comisiei Europene, prin care Greciei i se cerea sa recupereze alocatiile bugetare puse la dispozitia operatorului aerian. O prima decizie a CE a fost emisa in 2002, iar autoritatile elene au procedat la o restructurare a Olympic Airways, prin infiintarea unui nou operator de stat - Olympic Airlines, care a preluat avioanele, dar nu si datoriile fostei companii.
Procedura nu a fost considerata corecta de catre autoritatile de la Bruxelles, fiind cuantificata o suma uriasa acordata ca ajutor de stat: 41 de milioane de euro sub forma unor ajutoare financiare de restructurare, 40 de milioane ca plati pentru inchirierea avioanelor, 91,5 milioane constand in supraevaluarea unor active, 8 milioane pentru rambursarea unor imprumuturi de catre statul elen si 354 de milioane ca datorii catre buget.
Decizia CE de a obliga Guvernul elen sa recupereze ajutoarele de stat a fost atacata de Grecia la Curtea Europeana, pe motiv ca nu au fost indicate sumele exacte ce ar urma sa fie recuperate, dar judecatorii au considerat ca actiunea Atenei nu este intemeiata.
